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您的担忧是合理的。如果档案中缺失了1989年至1999年的特殊工种记录，确实可能影响您享受相关的退休待遇。根据《国务院关于工人退休、退职的暂行办法》及相关行业规定，特殊工种工人享有提前退休等权益，但这些权益的享受需以职工档案内有从事特殊工种的原始记录为前提。若缺失相关记录，可能导致您无法证明自己的工作年限和工种性质，进而影响退休待遇的享受。因此，建议您尽快与原单位沟通，尝试补充或确认这些记录。
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若原单位无法补充特殊工种记录，您可通过以下途径尝试证明：1. 查找当时的工作证明、工资单、劳动合同等文件，这些可能包含您的工种信息；2. 寻找当时的同事或上级作为证人，他们的证言可能有助于证明您的工作经历；3. 向劳动部门或行业协会咨询，看是否有其他官方途径可以验证您的特殊工种身份。
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从法律角度，您可先与原单位协商，要求其补充或更正档案中的特殊工种记录。若协商无果，可向当地劳动争议仲裁委员会提起仲裁，请求确认您的特殊工种身份及相应权益。同时，保留好所有可能证明您从事特殊工种工作的证据，以备不时之需。在仲裁或诉讼过程中，依据相关法律法规和行业规定，据理力争，维护自己的合法权益。
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